اختلف العلماء في تحديد المكان، وسنذكر ذلك حسب التّفاسير.
تفسير ابن كثير
ذكر إنّهما بحر فارس ممّا يلي المشرق، وبحر الروم مما يلي المغرب، حيث قال في تفسيره: (فلما بلغا مجمع بينهما نسيا حوتهما، وذلك لأنّه كان قد أمر بحمل حوت مملوح معه، وقيل له: متى فقدت الحوت فهو ثمّة، فسارا حتى بلغا مجمع البحرين، وهناك عين يقال لها عين الحياة، فناما هنالك، وأصاب الحوت من رشاش ذلك الماء، فاضطرب وكان في مكتل مع يوشع عليه السلام، وطفر من المكتل إلى البحر، فاستيقظ يوشع عليه السلام، وسقط الحوت في البحر، فجعل يسير في الماء، والماء له مثل الطاق لا يلتئم بعده، ولهذا قال تعالى: فاتخذ سبيله في البحر سربا أي مثل السرب في الأرض).
السيوطي في الدر المنثور
ذكر إنّهما بحر فارس والروم، هما بحر المشرق والمغرب؛ حيث قال: (وأخرج عبد الرزاق وابن المنذر وابن أبي حاتم، عن قتادة في قوله: مَجْمَعَ الْبَحْرَيْنِ قال: بحر فارس والروم، هما بحر المشرق والمغرب، وأخرج ابن أبي حاتم عن الربيع بن أنس مثله، وأخرج ابن المنذر وابن أبي حاتم عن أبي بن كعب في قوله: مَجْمَعَ الْبَحْرَيْنِ قال: أفريقية، وأخرج ابن أبي حاتم عن محمد بن كعب في قوله: مَجْمَعَ الْبَحْرَيْنِ قال: طنجة، وأخرج ابن أبي حاتم عن السدي في قوله: مَجْمَعَ الْبَحْرَيْنِ قال: الكر والرس؛ حيث يصبان في البحر).
السيّد قطب في تفسيره ظلال القرآن
ذكر إنّهما بحر الروم وبحر القلزم، أي البحر الأبيض والبحر الأحمر؛ حيث قال: (والأرجح ــ والله أعلم ــ أنه مجمع البحرين: بحر الروم وبحر القلزم، أي البحر الأبيض والبحر الأحمر، ومجمعهما مكان التقائهما في منطقة البحيرات المرة وبحيرة التمساح، أو إنّه مجمع خليجي العقبة والسويس في البحر الأحمر، فهذه المنطقة كانت مسرح تاريخ بني إسرائيل بعد خروجهم من مصر).