يستخدم هيدروكين من أجل: [4]
منع أو علاج التهابات الملاريا التي تسببها لدغات بعض أنواع البعوض، لكن الدواء لا يعمل ضد أنواع معينة من الملاريا المقاومة للكلوروكين.
علاج بعض أمراض المناعة الذاتية مثل الذئبة والتهاب المفاصل الروماتويدي.
تقليل مشاكل الجلد
منع التورم
تقليل ألم المفاصل