بعد تشخيص استسقاء الكلى عند الجنين يتوجب على الأم الحامل التوجه إلى طبيب مسالك بولية للأطفال لمراقبة حالة الجنين.
تعتمد الخطة العلاجية اللازمة لعلاج كبر حجم الكلى عند الجنين على مدى استسقاء الكلى، إذ يتم تصنيف درجة الاستسقاء بمقياس خاص يتضمن أربع درجات من الأخف إلى الأشد ضررًا.
في أغلب الأحيان لا يؤثر كبر حجم الكلى عند الجنين في رحم أمه على صحته. كما قد تتحسن المشكلة من الدرجة الأولى والثانية والثالثة من تلقاء نفسها بعد الوصول إلى الثلث الأخير من الحمل.
قد يضطر الطبيب إلى وصف أنواع محددة من المضادات الحيوية لتجنب حدوث عدوى الكلى.
في حالات محددة من كبر حجم الكلى عند الجنين من الدرجة الرابعة قد يلجأ الطبيب إلى إجراء عملية جراحية؛ لحل المشكلة وتصحيح الوضع.