التنفس الخلوي هو مجموعة من التفاعلات الايضية تحدث بالخلايا الحية، لتحويل الطاقة الكيميائية الحيوية وهي تفاعلات تستعمل الطاقة لتبسيط جزيئات معينة معقدة تتفاعل مع الاكسجين لإنتاج الطاقة تحدث عملية التنفس الداخلي للخلايا الحيوانية او الخلايا النباتية، ومن خلال هذه العملية تستعمل مواد الغذاء لإنتاج مركبات هامة مثل الجلوكوز، والاحماض الأميبية والدهون، وهناك بعض الكائنات الحية ذاتية التغذية مثل البكتيريا تتمكن من انتاج المركبات من خلال وسائل أخرى، وتوجد العديد من الكائنات الحية تحتاج للأكسجين.