يفسر المركز الطبي لجامعة ميريلاند أن الكابسيسين مرتبط باضطرابات المعدة وتلف الكلى والكبد، وقد ارتبط استهلاك الكابسيسين بزيادة حموضة المعدة وكذلك تقليل تأثير الرانيتيدين وغيرها من أدوية علاج الحموضة، الكابسيسين يعزز أيضا آثار الأدوية التي تؤدي لسيولة الدم.