يمكن الحد من مشكلات الإكتئاب المصاحبة القولون العصبي عن طريق:
أدوية مضادات الاكتئاب، حيث اشارت العديد من الدراسات مدى دورها في تقليل حدة أعراض القولون العصبي.
علاج الكتئاب النفسي، مثل: الاسترخاء الكامل وتخيل الأحداث المبهجة، دون ترك السبيل لعقلك بالتفكير في أعراض القولون العصبي التي قد تصيبك.
علاج سلوكي معرفي،ويهدف إلى تغيير سلوك المصاب بالمشاكل النفسية نحو فهم طبيعة المرض وتغيير مفهومه عنه.